rbenv を使っているなら、 ruby-build でインストールしたもの以外にも 自分でビルドした ruby も rbenv で切り替えたくなることがありますが、 これは簡単に出来ます。
元々 rbenv に ruby-build が必須というわけではないので、 configure の --prefix に ~/.rbenv/versions/some-name を指定してインストールすれば良いだけです。
名前にはシェルで特別な意味を持つ文字を避ければ 何でも良さそうですが、 rbenv install で上書きされてしまう危険があるのと 単純に紛らわしいので、 ruby-build でインストール出来る名前は避けた方が無難だと思います。
例えば以下のように configure してインストールすれば rbenv shell trunk などで ruby-build でインストールしたものと同様に使えます。
./configure --prefix=$HOME/.rbenv/versions/trunk --enable-shared --enable-debug-env CPPFLAGS=-DRUBY_DEBUG_ENV./configure --prefix=$HOME/.rbenv/versions/git --enable-shared --enable-debug-env CPPFLAGS='-DRUBY_DEBUG_ENV -DARRAY_DEBUG'./configure --prefix=$HOME/.rbenv/versions/git-debug --enable-shared --enable-debug-env CPPFLAGS='-DRUBY_DEBUG_ENV -DARRAY_DEBUG -DBIGDECIMAL_DEBUG'
$HOME を使っている理由は --prefix=~/path/to/somewhere だと configure の実行前には展開されず、 autoconf の configure ではなかったと思いますが、 ./~/path/to/somewhere にインストールされてしまうという問題が起きたことがあったので、 それ以来 $HOME を使って目の前でフルパスに展開されるようにしています。
-DRUBY_DEBUG_ENV などを渡すのに CPPFLAGS を使うのは chkbuild のやり方を Ruby CI のログをみて参考にしました。
安定したビルドを使いたいのなら、 Ruby CI で使われているのと同じような引数を使うのが良いと思います。
普段私が使っているのは CPPFLAGS='-DRUBY_DEBUG_ENV -DARRAY_DEBUG です。
-DBIGDECIMAL_DEBUG まで付けると、デバッグ出力が多すぎたり、 make test-all が途中で止まってしまったりして 問題が起きそうなので、 おすすめしません。